黄祖耀多年来致力于支持育人事业，与他接触过的教育工作者都感受到他对教育工作的关心。即使年事已高，他依然主持校董会议，关注学校的发展并支持校园活动。

也是中正董事会主席的黄祖耀2021年11月在南洋初级学院为“中正人”塑像主持推介仪式，并捐赠20万元给南初设立中正人奖学金，鼓励品德优秀或在美术、体育及社区服务等领域有杰出表现的学生。

中正中学（总校）、中正中学（义顺）和南洋初级学院如今各有一座“中正人”塑像，象征三校同属中正大家庭。

2017年至2023年担任南初校长的刘俊铭接受《联合早报》访问时说，黄祖耀亲临南初校园主持“中正人”塑像推介仪式，可见他对学校和教育事业的重视。他当时也和一些学生交流，以前辈的身份鼓励学生。“南初过去两年颁发了20份中正人奖学金，支持来自不同背景的学生发挥所长，回馈社会。黄主席的慷慨捐助，以及对学校多年来的支持，得以让学子在良好的学习环境成长。”

中正中学（总校）校长姚至轩也说，黄祖耀热心于教育事业，为提升学校设施慷慨解囊。他主持校董会议时都会关注学校项目的进展、学生的全面教育、学校设施是否有提升的需要。“学校的大礼堂翻新工程也有赖于黄主席的支持。黄主席为中正培育历代莘莘学子所做出的贡献，我们会永远铭记于心。”

中正三校的学生领袖届时将代表学生到黄祖耀的灵堂吊唁，全体师生周一开课时也会为主席的离世默哀一分钟。

黄祖耀在1970年至1980年担任南洋大学理事会主席，2004年受委南洋理工大学（简称南大）名誉副校长。

南大校长何德华教授星期六（2月3日）在发给南大社群的信函中说，黄祖耀是卓有成就的银行家、企业家和社区领袖，极力倡导教育、慈善事业和社区服务。

他提到，黄祖耀与南大渊源深厚。这些年来，黄祖耀、黄氏基金和大华银行捐赠了1600万元给南大，以支持教育、推进研究，为来自弱势背景的学生提供财务援助，以及栽培未来领袖。

黄祖耀为南大做出的一些贡献包括设立了黄氏基金助学金，帮助有经济困难的学生，以及设立大华银行银行教授席和黄祖耀金融硕士学位奖学金。

配合成立80周年，大华银行在2015年设立“黄祖耀未来领袖奖”，这个教育基金将为来自贫困家庭的新加坡国立大学和南洋理工大学学生，提供总值5000万元的奖学金。

为肯定黄祖耀为南大和社区的杰出贡献，他在2014年获颁名誉文学博士学位。

何德华说，南大对黄祖耀的离世表示哀悼。“那些有机会和他（黄祖耀）共事的人都记得，他为人慷慨，总是愿意聆听年轻人的想法，并为他们提供建议。”

“黄博士的精神将通过他于南大及以外所激励过的人中，继续传承下去。”