对于“清华海峡研究院新竹办公室”被要求停止运作一事，台湾教育部长潘文忠说，政府鼓励两岸大学正常学术交流，但不能抵触法律。

据中时电子报报道，台立法院教育及文化委员会今天审查教育部预算，潘文忠在会前接受媒体采访时表示，台湾清华大学在未经政府许可下，将办公空间租给清华海峡研究院，该院是中国政府的组织，这已违反台湾法律。

潘文忠说，清大校园是公有财产，校方不能将空间租出去却不管理。教育部昨天也再度发函各大学自我检视及内控，学术交流不能抵触法律。

潘文忠强调，教育部鼓励两岸大学正常、正确的学术交流，但不能违法。

台湾清华大学校友会与中国大陆厦门市政府、北京清华大学在台湾清大校内共设“清华海峡研究院”、“清华海峡研究院新竹办公室”，从事技术研发、揽才、投资，台国安单位质疑该机构被中共渗透，台教育部要求该办公室停止运作，并将全面盘点两岸高教交流状况。